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<!DOCTYPE html>

<title>Molecular Combing</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Molecular Combing</span></h1>

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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p><span lang="en"><b>Molecular Combing</b></span> (engl., synonym <span lang="en"><i>chromosome combing</i></span>, zu deutsch etwa ‚molekulares Kämmen‘) ist eine biochemische und biophysikalische Methode zur Ausrichtung und Dehnung von <a href="Polymer" title="Polymer">Polymeren</a> wie <a href="Chromosom" title="Chromosom">chromosomale</a> <a href="DNA" class="mw-redirect" title="DNA">DNA</a>.<sup id="cite_ref-PMID_7522347_1-0" class="reference"><a href="#cite_note-PMID_7522347-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Prinzip">Prinzip</h2></div>

<p>Die chromosomale DNA wird an einer Oberfläche befestigt, z. B. durch <a href="Hybridisierung_(Molekularbiologie)" title="Hybridisierung (Molekularbiologie)">Hybridisierung</a> an befestigte <a href="Oligonukleotid" class="mw-redirect" title="Oligonukleotid">Oligonukleotide</a> oder durch <a href="Kovalente_Bindung" title="Kovalente Bindung">kovalente Bindung</a> an eine <a href="Silanisierung" title="Silanisierung">silanisierte</a> Oberfläche, z. B. ein <a href="Deckglas" title="Deckglas">Deckglas</a>.<sup id="cite_ref-PMID_15239885_2-0" class="reference"><a href="#cite_note-PMID_15239885-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Durch Absenken eines <a href="Meniskus_(Hydrostatik)" title="Meniskus (Hydrostatik)">Meniskus</a> bei einer Geschwindigkeit von etwa 300 μm/s wird die DNA ausgerichtet. Die DNA verbleibt bevorzugt in der flüssigen Phase. Die Zugkräfte des sinkenden Meniskus sind geringer als die Kräfte der Hybridisierung, weshalb die DNA an der Oberfläche gebunden bleibt und ausgerichtet und gedehnt wird. Dabei wird die DNA auf etwa 2 <a href="Kilobase" class="mw-redirect" title="Kilobase">kb</a>/μm gedehnt (150 % der <a href="Konturl%C3%A4nge" title="Konturlänge">Konturlänge</a> eines <span lang="en"><i>random coil</i></span>, aufgrund einer Kraft von 65 pN)<sup id="cite_ref-PMID_15239885_2-1" class="reference"><a href="#cite_note-PMID_15239885-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>, wodurch sich in folgenden mikroskopischen Betrachtungen eine verbesserte Auflösung ergibt.<sup id="cite_ref-PMID_7522347_1-1" class="reference"><a href="#cite_note-PMID_7522347-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p><p>Das <span lang="en"><i>molecular combing</i></span> wird unter anderem bei der <a href="Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung" class="mw-redirect" title="Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung">Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung</a> (FISH) verwendet.<sup id="cite_ref-3" class="reference"><a href="#cite_note-3"><span class="cite-bracket">[</span>3<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Durch molekulares Kämmen ergibt sich in der FISH eine Auflösung von 300 <a href="Basenpaar" title="Basenpaar">bp</a>.<sup id="cite_ref-PMID_20154468_4-0" class="reference"><a href="#cite_note-PMID_20154468-4"><span class="cite-bracket">[</span>4<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Anwendungen">Anwendungen</h2></div>

<p>Aufgrund der verbesserten Auflösung kann per FISH z. B. die Geschwindigkeit der <a href="Replikationsgabel" class="mw-redirect" title="Replikationsgabel">Replikationsgabel</a> beim Einbau von <a href="BrdU" class="mw-redirect" title="BrdU">BrdU</a> gemessen werden,<sup id="cite_ref-5" class="reference"><a href="#cite_note-5"><span class="cite-bracket">[</span>5<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> die Länge von DNA exakter bestimmt werden<sup id="cite_ref-PMID_20154468_4-1" class="reference"><a href="#cite_note-PMID_20154468-4"><span class="cite-bracket">[</span>4<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> oder instabile Chromosomen (z. B. bei <a href="Krebs_(Medizin)" title="Krebs (Medizin)">Krebs</a>) untersucht werden.<sup id="cite_ref-6" class="reference"><a href="#cite_note-6"><span class="cite-bracket">[</span>6<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-PMID_7522347-1"><span class="mw-cite-backlink">↑ <sup><a href="#cite_ref-PMID_7522347_1-0">a</a></sup> <sup><a href="#cite_ref-PMID_7522347_1-1">b</a></sup></span> <span class="reference-text">A. Bensimon, A. Simon, A. Chiffaudel, V. Croquette, F. Heslot, D. Bensimon: <i>Alignment and sensitive detection of DNA by a moving interface.</i> In: <i>Science.</i> Band 265, Nummer 5181, September 1994, <span class="-print"><a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%220036-8075%22&key=cql">0036-8075</a></span></span>, S. 2096–2098, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7522347?dopt=Abstract">PMID 7522347</a>.</span>

</li>

<li id="cite_note-PMID_15239885-2"><span class="mw-cite-backlink">↑ <sup><a href="#cite_ref-PMID_15239885_2-0">a</a></sup> <sup><a href="#cite_ref-PMID_15239885_2-1">b</a></sup></span> <span class="reference-text">R. Lebofsky, A. Bensimon: <i>Single DNA molecule analysis: applications of molecular combing.</i> In: <i>Briefings in functional genomics & proteomics.</i> Band 1, Nummer 4, Januar 2003, <span class="-print"><a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%221473-9550%22&key=cql">1473-9550</a></span></span>, S. 385–396, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15239885?dopt=Abstract">PMID 15239885</a>.</span>

</li>

<li id="cite_note-3"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-3">↑</a></span> <span class="reference-text">X. Michalet, R. Ekong, F. Fougerousse, S. Rousseaux, C. Schurra, N. Hornigold, M. van Slegtenhorst, J. Wolfe, S. Povey, J. S. Beckmann, A. Bensimon: <i>Dynamic molecular combing: stretching the whole human genome for high-resolution studies.</i> In: <i>Science.</i> Band 277, Nummer 5331, September 1997, <span class="-print"><a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%220036-8075%22&key=cql">0036-8075</a></span></span>, S. 1518–1523, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9278517?dopt=Abstract">PMID 9278517</a>.</span>

</li>

<li id="cite_note-PMID_20154468-4"><span class="mw-cite-backlink">↑ <sup><a href="#cite_ref-PMID_20154468_4-0">a</a></sup> <sup><a href="#cite_ref-PMID_20154468_4-1">b</a></sup></span> <span class="reference-text">N. Ohmido, K. Fukui, T. Kinoshita: <i>Recent advances in rice genome and chromosome structure research by fluorescence in situ hybridization (FISH).</i> In: <i>Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences.</i> Band 86, Nummer 2, 2010, <span class="-print"><a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%221349-2896%22&key=cql">1349-2896</a></span></span>, S. 103–116, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20154468?dopt=Abstract">PMID 20154468</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3417561/">PMC 3417561</a> (freier Volltext).</span>

</li>

<li id="cite_note-5"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-5">↑</a></span> <span class="reference-text">C. Conti, B. Saccà, J. Herrick, C. Lalou, Y. Pommier, A. Bensimon: <i>Replication fork velocities at adjacent replication origins are coordinately modified during DNA replication in human cells.</i> In: <i>Molecular biology of the cell.</i> Band 18, Nummer 8, August 2007, <span class="-print"><a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%221059-1524%22&key=cql">1059-1524</a></span></span>, S. 3059–3067, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1091/mbc.E06-08-0689">10.1091/mbc.E06-08-0689</a></span>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17522385?dopt=Abstract">PMID 17522385</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1949372/">PMC 1949372</a> (freier Volltext).</span>

</li>

<li id="cite_note-6"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-6">↑</a></span> <span class="reference-text">J. Herrick, A. Bensimon: <i>Introduction to molecular combing: genomics, DNA replication, and cancer.</i> In: <i>Methods in Molecular Biology.</i> Band 521, 2009, <span class="-print"><a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%221064-3745%22&key=cql">1064-3745</a></span></span>, S. 71–101, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1007/978-1-60327-815-7_5">10.1007/978-1-60327-815-7_5</a></span>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19563102?dopt=Abstract">PMID 19563102</a>.</span>

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